菜花的根系为直根系,比较发达,根系入土深度达50 厘米以上,而主要根群分布在35厘米以内的土壤耕层中。根系的再生能力较强,可以育苗移栽。
菜花的茎比较粗壮,稍短缩,茎上的叶芽不萌发,阶段发育形成后,抽生花茎,茎顶部着生肥大的花球。茎上着生叶子,下部的叶子脱落后有明显的茎秆。在适宜的环境条件下任其生长,则花枝会逐渐伸长,并开花,结荚。
菜花的叶呈长卵形或披针形,叶子狭长,叶先端尖,叶缘锯齿形,且叶柄较长。叶面不很光滑,有蜡粉,无毛,叶色绿或深绿色。
菜花的花球是产品器官,花球由肥嫩多汁的主轴、短缩肥嫩的50~60个肉质花梗组成。一个肉质花梗是由具有若干个花枝组成的小花球体。正常花球呈半球形,表面呈现颗粒状,质地致密。花枝伸长后,花枝顶端可分化形成正常的花蕾,只有一部分在花枝顶端的花蕾能正常开花。复总状花序,完全花,花萼绿或黄绿色,花冠黄或乳黄色,四强雄蕊,子房上位,异花授粉,虫媒花。果实为长角果,先端喙状,成熟爆裂,每个长角果含种子10余粒。种子近圆形,褐色,千粒重3~3.5克。
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