南方的岛上，专门用于培育决斗者的デュエルアカデミア高校。每一个年级的学生大概50人，一共150人左右。为寄宿制的学校。根据学生成绩的好坏，分成3个等次优等生的“奥拍利斯·蓝”排第2的“太阳神·黄”还有劣等生的“奥斯里斯·红”是一个个人主义，弱者被冷落看不起的学院。某天来了一个少年……
